含羞草传媒

Varianta de coronavirus depistat膬 ini葲ial 卯n Marea Britanie, B.1.1.7, 葯i caracterizat膬 printr-o transmisibilitate crescut膬 a fost identificat膬 la Suceava 卯n urma secven葲ierilor efectuate la Universitatea 鈥炄榯efan cel Mare鈥� din Suceava. Proba biologic膬 a fost recoltat膬 la Spitalul jude葲ean de urgen葲膬 鈥濻f. Ioan cel Nou鈥� din Suceava de la un pacient cu un istoric recent 卯n Marea Britanie.

Tulpina secventia葲膬 apar葲ine unui lot de 20 de probe ce au fost analizate 卯n ultima s膬pt膬m芒n膬 卯n cadrul Laboratorului de Metagenomic膬 葯i Biologie Molecular膬 al Universit膬葲ii 鈥炄榯efan cel Mare鈥� din Suceava, probe provenind de la Institutul Oncologic 鈥濸rof. Dr. Ion Chiricu牛膬鈥� din Cluj-Napoca, Universitatea de Medicin膬 葯i Farmacie din Craiova 葯i Spitalul jude葲ean de urgen葲膬 Suceava.

脦n cazul probei men葲ionate anterior, s-a constatat c膬 prezint膬 muta葲iile inregistrate la nivelul a 4 proteine, si anume ORF1ab, S, ORF8 si N (Tabelul 1),. Aceste mutatii suntcaracteristice noii tulpini SARS-CoV-2, denumit膬 varianta B1.1.7, 20I/501Y.V1 sau VOC 20201/01. Adi葲ional, s-au mai 卯nregistrat 11 alte muta葲ii, distribuite in cadrul acelora葯i 4 gene.

Tabel 1. Muta葲iile 卯nregistrate la tulpina secven葲iat膬 din Suceava, corespunz膬toare tulpinii de referin葲膬 B.1.1.7 (20I/501Y.V1)

 

笔谤辞迟别颈苍膬	Muta葲ii inregistrate
ORF1ab	Ala708Asp, Ile2230Thr, Ser3675_Phe3677 del
S	His69_Val 70 del, Tyr145del (432_434 del TTA), Asn501Tyr (N501Y), Ala570Asp, Asp614Gly, Pro681His, Thr716Ile, Ser 982Ala, Asp1118His
ORF8	Gln18* stop, Gln27* stop, Arg52Ile, Tyr73Cys
N	Asp3Leu, ArgGly203LysArg, Ser235Phe

 

 

Dintre muta葲iile observate, prezint膬 o importan葲膬 deosebit膬 muta葲ia N501Y, a proteinei spike (S) responsabil膬 de ata葯area de celulele gazdei potential infectate si care, conform studiilor, confer膬 o mai mare transmisibilitate a virusului. De asemenea, este prezent膬 muta葲ia del69_70 HV, care poate determina rezultate echivoce (sau chiar fals-negative) la anumite tipuri de teste de diagnostic PCR. 葮i acest aspect poate conduce, indirect, la o rat膬 mai mare de transmitere a virusului, datorate liberei circula葲ii a persoanelor infectate, dar cu r膬spuns fals-negativ la test.

脦n continuare, celelalte 19 probe neasociate tulpinii britanice 聽vor fi analizate pentru a stabili prezen葲a muta葲iilor caracteristice altor noi variante, precum cele identificate recent ca provenind din Africa de Sud 葯i Brazilia, ce se considera a avea, de asemenea, un grad mai mare de transmisibilitate. Totodat膬, vor fi analizate independent toate muta葲iile 卯nregistrate 卯n probele secven葲iate, din punctul de vedere al impactului epidemiologic pe care ar putea sa-l aib膬.

Secven葲ele ob葲inute vor fi 卯nc膬rcate 卯n bazele interna葲ionale de date, pentru a se stabili poten葲ialele rute de transmisie, precum 葯i legatura cu alte tulpini, la nivel mondial. De asemenea, 卯nc膬rcarea secven葲elor 卯n astfel de baze de date, permite cercet膬torilor din 卯ntreaga lume evaluarea mai precis膬 a circula葲iei virusului pe Glob 葯i monitorizarea acelor variante poten葲ial mai periculoase.

La momentul actual, 卯n principala baz膬 interna葲ional膬 de secven葲e SARS-CoV-2, GISAID , se afl膬 卯nregistrate 159 de secvente originare din Rom芒nia, care au satisf膬cut standardele de calitate impuse pentru indexare. Dintre acestea, 62 de probe au fost secven葲iate la Universitatea 鈥炄榯efan cel Mare鈥� din Suceava, 29 la Institutul National de Boli Infectioase 鈥濸rof. Dr. Matei Bals鈥� din Bucure葯ti, 27 la Institutul Na葲ional de Cercetare Dezvoltare Medico-Militar膬 鈥濩antacuzino” din Bucure葯ti 葯i 1 la Institutul Na葲ional de Cercetare-Dezvoltare pentru Microtehnologie 鈥� Bucure艧ti, iar alte 40 de probe recoltate de la pacien葲i din Rom芒nia au fost secven葲iate 卯n laboratoare din str膬in膬tate.

Comisia European膬 a recomandat 牛膬rilor europene s膬 卯艧i 卯nnoiasc膬 strategiile de testare pentru a r膬spunde noilor tulpini 葯i s膬 creasc膬 urgent secven牛ierea genomic膬 cel pu牛in p芒n膬 la 5%, preferabil p芒n膬 la 10% din rezultatele pozitive. Aceasta ar 卯nsemna efectuarea unui num膬r 卯ntre 5.000 葯i 10.000 de secven葲ieri pe lun膬 卯n Rom芒nia. La Universitatea 鈥炄榯efan cel Mare鈥� din Suceava se pot secven葲ia lunar aproximativ 500 de probe, 卯n condi葲iile 卯n care sunt furnizate consumabilele necesare 葯i este asigurat膬 dublarea personalului specializat al laboratorului, costurile consumabilelor necesare per prob膬 pentru tehnologia de secven葲iere folosit膬 de 含羞草传媒 situ芒ndu-se sub 1000 lei.

Men葲ion膬m c膬 activitatea curent膬 de secven葲iere la Universitatea 鈥炄榯efan cel Mare鈥� din Suceava este par葲ial finan葲at de Ministerul Educa葲iei 葯i Cercet膬rii prin proiectul cu num膬rul PN-III-P2-2.1-SOL-2020-0142 coordonat de Prof. univ .dr. Mihai COVA葮膫, coordonarea 葯tiin葲ific膬 卯n cadrul 聽componentelor biologic膬, bioinformatic膬 葯i medical膬 fiind asigurat膬 de 葮ef lucr. dr. biolog Andrei LOBIUC, Prof.univ.dr. Mihai DIMIAN 葯i 葮ef lucr膬ri dr. medic Olga C膬liman-Sturdza,

卯n str芒ns膬 colaborare cu Laboratorul de diagnostic molecular 葯i Sec葲ia de boli infec葲ioase ale Spitalului jude葲ean de urgen葲膬 鈥濻f. Ioan cel Nou鈥� din Suceava, coordonate de 葮ef lucr膬ri dr. Roxana Filip 葯i, respectiv, dr. Monica Terteliu,

institu葲ii partenere 卯n acest proiect fiind 葯i Universitatea de Medicin膬 葯i Farmacie 鈥濾ictor Babe葯鈥� Timi葯oara – echip膬 coordonat膬 de c膬tre聽 prof. dr. C膬t膬lin MARIAN, Spitalul Clinic de Boli Infec葲ioase 葯i Pneumoftiziologie 鈥濪r. Victor Babe葯鈥� Timi葯oara – echip膬 coordonat膬 de c膬tre prof. dr. Cristian OANCEA, Institutul Oncologic 鈥濸rof. Dr. I. Chiricu葲膬鈥� Cluj-Napoca – echip膬 coordonat膬 de c膬tre C.S. Ovidiu B膫L膫CESCU, Universitatea de Medicin膬 葯i Farmacie Craiova – echip膬 coordonat膬 de c膬tre prof. dr. Mihai IOANA.